После периода рачленения Польши, когда польское государство объединилось, в начале XIV века два княжества были преобразованы в палатинаты. А приблизительно в XV веке название региона (Malopolska, Малая Польша, или по латински Polonia Minor) уже закрепилось, в отличие от Великой или Старой Польши (Wielkopolska, или по латински Polonia Major) — тот последний термин относился к землям вокруг городов Гнезно и Познань, которые являлись колыбелью польского государства. В XV веке был учрежден генеральный сеймик sejmik generalny (местный Парламент) Малопольского Воеводства с местонахождением в Новом Корчине. Период с начала XIV века до конца XVI века был временем решительного господства Малопольского Воеводства в политической, экономической и культурной жизни страны. Регион обиловал богатыми земельными владениями, с плодородными землями. С начала средневековья в регионе развивалась добыча соли и свинца, а также обработка железа. Городские центры гордились специализированными ремеслами и международной торговлей, процветали также художественные, гуманитарные и точные науки. В это время Краков проживал самый великолепный период в своей истории — он являлся столицей значительной монархии Ягеллонов; городом политики и торговли, внушительной архитектуры эпохи Готики и Ренессанса, местонахождением одного из самый старинных европейских университетов. Перенесение столицы в Варшаву в начале XVII века, а также опустошения, вызванные непрерывными войнами и стихийными бедствиями, в течение двух столетий привели Краков и Малопольское Воеводство к упадку. В результате трех разделов Польши, совершенных Россией, Пруссией и Австрией, Малопольское Воеводство попало под австрийское правление, с этого момента приобретая название Галиция. В последствии решений Венского Конгресса 1815 г., Краков стал свободным городом, а земли, расположенные севернее Вислы и Сана вошли в состав новоучрежденного Польского Колорества Krolestwo Polskie (Конгрессное Королество Польши), находящегося в строгой зависимости от России. C 1867 по 1873 год, Малопольское Воеводство получило значительную автономию, которая поспособствовала оживленному и бурному развитию польской культуры и искусства. В период раздела, эта область, а особенно Краков — национальное "святое святых" — стал настоящей "Малой Польшей": суррогатом свободной родины, в котором концентрировались чувства и надежды разделенного народа.
    В 1918 г. Малопольское Воеводство вернулось в пределы возрожденного польского государства, а Краков стал столицей Краковского Воеводства, охватывая центральные земли Малопольского Воеводства, т.е.: западную Галицию. После Второй мировой войны, границы Краковского воеводства лищь незначительно передвинулись, и сохранились в таком виде до 1975 г., когда Польша была вынуждена провести раздел на 49 неисторических региональных единиц.
    С 1999 г., административная реформа возвратила историческую форму Краковскому Воеводству, которое получило также название исторической области: Малопольское Воеводство.